《查理和巧克力工厂》（2005）

主演： 约翰尼·德普、弗莱迪·海默、海伦娜·伯翰·卡特
类型： 奇幻/ 家庭/ 冒险/ 歌舞/ 喜剧

将著名奇幻小说家罗尔德·达尔的同名经典小说《查理和巧克力工厂》搬上银幕，波顿再次与他的御用演员约翰尼·德普合作。“约翰尼和我谈话的过程有几分抽象和理论，但是不知怎的，我俩仍然理解彼此在说什么。达尔的作品最伟大之处在于为表现留下了很大的空间，所以我们有完全的自由来设计每一间房子的样子。我很高兴的是，不用十分严密地去（从书里）考证我们要制作的工厂是什么样的，或者去确认巧克力最恰当的黏稠度，以至于它看上去不像棕色的水。”

《僵尸新娘》（2005）

主演： 海伦娜·伯翰·卡特、艾米丽·沃森、约翰尼·德普
类型： 爱情/ 动画/ 奇幻/ 家庭/ 歌舞/ 喜剧

一个死去的新娘和她活着的爱人之间的故事，所以这一次蒂姆·波顿选择了用停格动画来表现，“（对于这部影片来说）用真人拍摄比较难表现到位，而运用停格动画则十分简单，只需要把他们表现得像木偶一样。他们看上去是如此漂亮又恰如其分。”
蒂姆·波顿对于亡灵和恐怖角色（在他的电影中，这种角色比活人反而更加令人同情和喜爱）的无限痴迷源自于恐怖电影的影响，“我想我喜欢表现亡灵是因为我在伯班克长大的缘故吧，而且我还有一种偏好，比如《活死人之夜》里那种大白天阳光灿烂的场景。我总是喜欢这些怪物片。”

《理发师陶德》（2007）

主演： 约翰尼·德普、海伦娜·伯翰·卡特、阿伦·瑞克曼
类型： 惊悚/ 犯罪/ 歌舞

再一次，波顿联合老友约翰尼·德普合作了这部恐怖音乐剧，当然演员阵容还包括他的爱人海伦娜·伯翰·卡特。影片中维多利亚时期伦敦灰色肮脏的街道就像是从狄更斯小说里搬出来的，不过，狄更斯的作品里可不会泼洒如此多的鲜血。“对于陶德来说，一切都是内心主观的，鲜血就是他情感的释放，影片更多的是关于宣泄。”影片结尾陶德之死更是惊心动魄，黑暗血腥得叫人毛骨悚然。

《蝙蝠侠归来》（1992）

主演： 米歇尔·菲佛、克里斯托弗·沃肯、迈克尔·基顿
类型： 动作/ 惊悚/ 犯罪

再度回归《蝙蝠侠》系列，这一次蒂姆·波顿获得了更多的支持，但是也面临更多关于人物造型和装备的压力。
波顿回忆道：“记得制作《蝙蝠侠归来》时，我和麦当劳的人坐在一起，他们想要知道企鹅人会是什么样子，因为他们想提前准备好包装纸的样式。”波顿如此说道，“我不得不告诉他们必须先制作出电影，而且我还不知道他将会是什么样儿。不过事实是，他们无论如何都不会喜欢他未来的模样，他绝对不适合快乐的快餐店风格。当你有了更多的拍摄预算时，就会有很多诸如此类的事情围绕着你，真是叫人很不痛快。”