所说的方法把鸣人制住。迪达拉被木叶的第三班及第七班围攻，迫虎跳墙下使出自爆方式，似要同归与尽，幸被卡卡西转移到另一空间……战斗结束，草原上躺著我爱罗的尸首，鸣人所表现的真摰友情，感动了千代婆婆，甘心牺牲自己的性命令我爱罗复活。我爱罗回归，砂隐村的民眾夹道欢迎，我爱罗第一次感到被其他人肯定的滋味。故鸣人们準备回归时，我爱罗心存感激双方的握手，代表著永恒的友谊……

天地桥之战

从『晓』的蝎口中得知其将与派往大蛇丸身边的卧底会面，认為是寻找佐助消息的好时机在五代目批准下，準备往会面地点──天地桥出发。由於卡卡西在与迪达拉一战中虚耗过多，无法同行，於是由原暗部成员、化名大和的天藏担任新队长，率鸣人、樱及新成员佐井前往目的地。虽然鸣人及樱对佐井的假意笑容及口不择言，没甚好感，但同意為了佐助，即使要与不喜欢的人合作也心甘情愿。到达天地桥后，大和偽装成蝎，接触蝎的卧底，而鸣人们躲在岩后静待指示。令一行人惊讶的是，原来这名卧底就是药师兜。及后大蛇丸亦出现，大和的偽装身份亦被揭穿，双方交战起来。鸣人受到挑衅，化身成四尾妖狐，失去意志，还把小樱弄伤。大蛇丸与鸣人间爆发激战，被兜称為『怪物间的战斗』。后大蛇丸因三年限期已到，身体不能承受，不敢恋战而去鸣人亦被大和操控尾兽的力量所压制，变回人类的状态。清醒过后，得悉是自己伤害了樱而悔疚，但同意大和所说，要不断锻鍊自己本身的力量去保护身边重要的人。

重见佐助篇

天地桥一战后，鸣人们继续追踪大蛇丸一眾，却得悉佐井背叛了他们。此时大和的木分身已查出大蛇丸巢穴的所在地，鸣人们便决定深入虎穴。他们先找到佐井，并将其綑绑起来佐井问鸣人為什麼执著於要拯救佐助，鸣人却说这是因為他与佐助之间，有著兄弟般的『羈绊』。佐井為其所动，想亲眼看看『羈绊』的意义，终弃暗投明，并反过来合力把刚到的药师兜制服。鸣人与佐井冰释成嫌，组队在大蛇丸巢穴内寻找佐助的下落。不料却又遇上大蛇丸，於是鸣人让佐井先往寻佐助，自己则应付大蛇丸。及后樱及大和前来助阵，大蛇丸又再遁去无踪。鸣人们从佐井临走时遗下的秘策中，赫然发现原来佐井此行目的，是要暗杀佐助，不禁又忧心起来。突然一声巨响，引起鸣人们的注意，并急步赶往现场，只见佐井正呆站著。忽又传来一把熟悉的声音，只见爆炸后地面上站著一个人，正是佐助!!重遇佐助，鸣人首先是表现兴奋，但佐助冷漠的态度及身手的敏捷却出乎意料之外。佐助称要把鸣人杀掉，以斩断彼此间的『羈绊』又道出刚才佐井说要替鸣人带他回木叶之事。奇妙的是，大蛇丸及兜此度又再出现，竟阻止佐助杀鸣人他们，目的是要留下能剷除『晓』的力量。佐助不再执著，跟著大蛇丸离去……救回佐助的目标再度失败，但却得到了真心的伙伴佐井……

飞段、角都篇

鸣人重新投入训练，并得到卡卡西及大和的指点。鸣人得知自己的能力属於『风』属性，為加快训练效果，他以多重影分身术进行修行，并前往同有『风』属性的猿飞阿斯玛处寻求指点。后阿斯玛对上『晓』的飞段、角都，战败阵亡，第十班意欲报仇，卡卡西暂时把修行之事交给大和处理、而自己负责照顾第十班。后卡卡西所率的第十班与飞段、角都陷入苦战，幸亏大和及时率领鸣人、佐井、樱三人赶到，加入战团，鸣人更与大和一起使出风水混合术『颶风水涡之术』，抵消角都的风火混合攻击。鸣人以新术风遁·螺旋手裡剑攻击角都，但第一次失败了。卡卡西认為应对角都进行围攻方妥当，但凭著鸣人要超越四代火影的决心，卡卡西让鸣人作第二次攻击。鸣人亦不负所託，以影分身成功欺骗角都，并从其背后施以风遁·螺旋手裡剑，给予绝命一击角都倒在地上动弹不得，由卡卡西了结其生命。鹿丸亦把飞段击败后，眾人又回到木叶忍村……

宇智波佐助追捕篇

為了得知晓的情报，及追寻佐助的下落，木叶决定锁定以宇智波鼬為目标的追捕计划，而鸣人的大和班和卡卡西新领的第八班一起联手行动。途中鸣人的影分身曾一度遇上宇智波鼬，鼬当时亦有话希望跟鸣人说，可惜却因為鸣人的衝动打断了话题。但鼬临走前却赋予了鸣人神秘的力量，并说在必要时才用此力量等等。后眾人对上了『晓』的宇智波班，鸣人的螺旋丸、志乃的虫玉及牙的通牙之术均对其无效就在此时，『晓』的绝前来汇报佐助与鼬的战果，佐助的胜利及战后受重创使鸣人感惊愕及担心，并曾指骂绝是『芦薈』、要他说出佐助在那裡。收到情报的班不再恋战，及绝一起前往战场把鼬的尸体及佐助带走。鸣人们急步追赶，虽找出战场位置，但早已人去楼空了……

本篇

再次寻找佐助的踪影失败后，回到木叶，却惊闻自来也被潘恩杀害的恶耗。為此曾一度悲伤的他，因為伊鲁卡老师和鹿丸的鼓励，而再度重新振作起来，并协助解开自来也临终前留下的暗号可惜的是仍然没有头绪。為了替自来也报仇，他决定接受深作大人的提议，前往自来也曾修行的妙木山，作艰苦的『仙术』训练。训练期间，鸣人险变青蛙，幸得深作大人用术阻止，不过呜人却整身是伤。经过一番修行，鸣人总算是基本掌握了自然力量，故深作大人建议转為不用蛤蟆油的练习，同时也给了鸣人自来也的遗作──『百鍊忍传』。

420话中，鸣人基本已掌握了深作所授的『蛙蹼手』，及能在不动的状态下吸收自然力量，控制仙术查克拉。此时深作告诫鸣人有关仙人模式的缺点，就是只能维持5分鐘左右而且每一次使用前，需经一段时间、在静止的状态下吸取足够的自然力量方可。因此如果在不动的状态下，就很容易成為敌人的靶子。為免如此，使用时就必须有其他伙伴同在，以為其争取充裕的时间吸收自然力量。但深作自认為最有效的方法，就是与鸣人融為一体，以求能同时分担『动』和『静』两边的工作。 另一边厢，木叶隐村正受到潘恩的摧毁，身為五代火影的纲手，目前只能祈求鸣人这位『预言之子』的回归……

●忍术

千年杀

得到卡卡西老师的真传，说是体术奥义，以虎印将手指插入敌人的查克拉最薄弱的位置(肛门)，进阶者以手裡剑加上起爆符代替,是恶搞和实用兼备的体术。

风水遁·颶风水涡之术

以风遁·螺旋丸跟大和的水遁&